Cuando no puede ser digerida la lactosa, esta pasa sin ser hidrolizada hasta el intestino grueso donde fermentará dando dióxido de carbono, ácidos orgánicos, hidrógeno y metano. Todos estos productos derivados de la fermentación y el exceso de agua retenida en el colon, son responsables de los dolores abdominales, pérdida del apetito, diarrea y flatulencia que tienen lugar cuando existe una deficiencia grave de lactasa o al consumir cantidades elevadas de leche.